| 类群 | 云南种数 | 中国种数 | 世界种数 | 云南占中国总种数% | 云南占世界总种数% |
| 兽类 | 304 | 607 | 4181 | 50.1 | 7.3 |
| 鸟类 | 810 | 1244 | 9040 | 65.1 | 9.0 |
| 爬行类 | 170 | 376 | 6300 | 45.2 | 2.7 |
| 两栖类 | 120 | 284 | 4010 | 42.3 | 3.0 |
| 昆虫 | 13,000 | 51,000 | 920,000 | 25.5 | 1.4 |
| 鱼类 | 432 (淡水) | 3862 (淡水1000) | 21,400 | 43.2 (占淡水) | - |
| 被子植物 | 13,160 | 30,000 | 260,000 | 43.9 | 5.1 |
| 裸子植物 | 100 | 270 | 900 | 37.0 | 11.1 |
| 蕨类植物 | 1500 | 2600 | 12,000 | 57.7 | 12.5 |
| 苔藓植物 | 1651 | 2900 | 23,000 | 56.9 | 7.2 |
| 淡水藻类 | 800 | 9000 | 25,000 | 8.9 | 0.3 |
| 竹类植物 | 250 | 500 | 1000 | 50.0 | 25.0 |